Bei Franziskus findet sich nie ein einziges Wort des Streits, der Kritik oder des Vorwurfes gegenüber den Männern der Kirche. In ihnen "sieht er den Sohn Gottes". Diese Liebe eines Sohnes für die Kirche will er auch von seinen Brüdern.

Auch unter diesem Gesichtspunkt ist Antonius "Franziskaner". Er liebt die Kirche und stellt sich ihr vollständig zur Verfügung. Die Kirche ist für ihn die Familie, in der die Gläubigen leben: "Wer Gott besitzen will und den sicheren Weg zur Vertrautheit mit Ihm finden will, muss in seiner Familie bleiben, ein Familienleben führen, denn in ihr erfüllen sich die Beziehungen zwischen dem himmlischen Vater und den Brüdern im Glauben und in der Liebe." Die Liebe zur Kirche erfüllt das Herz des Heiligen und treibt ihn dazu, die Mühen der Evangelisation auf sich zu nehmen.

Diese Liebe wird von ihm jedoch nach seinem eigenen Temperament gelebt; wenn sie sich in Franziskus wie die Verehrung eines Sohnes ausdrückt und sich der Hierarchie beugt, so kann sie in Antonius auch zum starken und schockierenden Vorwurf werden. Der Heilige erspart den Männern der Kirche, die Jesus Christus nicht würdig vertreten, keine harten Worte, seien es einfache Priester und Religiöse oder Bischöfe und Kardinäle: "Die Führer der Kirche sind alle blind, ohne jegliches Licht des Lebens und der Wissenschaft, stumme Hunde, unfähig zu kläffen. Sie sehen Gespenster, weil sie für Geld predigen… Erzbischöfe, Bischöfe und Prälaten der Kirche kommen und gehen, kaufen und verkaufen die Wahrheit durch Lügen und unterdrücken die Gerechtigkeit durch Ämterhandel… Die Familie der Gläubigen entfernt sich von der Festigkeit des Glaubens und der Heiligkeit des Lebens, auf Grund des Beispiels der schlechten Prälaten…"

Es ist die Liebe zur Kirche, es ist der Eifer, die Brüder zu retten, die Antonius feurige, brennende und einschneidende Worte in den Mund legen, die oft die Bekehrung und die Reue bewirken, und ihn zu einem aufrichtigen und freien Propheten machen. Das Herz Antonius schlägt im Gleichklang mit dem Jesu' und die Verbitterung des Herren gegenüber der Härte der Pharisäerherzen ist auch seine eigenen Verbitterung: "Denn, wenn heute ein Esel stürzt, dann gibt es jemanden, der ihn hochzieht; stirbt jedoch eine Seele, dann gibt es niemanden, der ihr zu Hilfe eilt!"